Dieses Kirchengebäude wurde von der Gemeinde Bödexen – sicherlich unter dem Einfluss des Klosters Corvey – nach dem Ende des 30-jährigen Krieges in den Jahren 1681 bis 1683 errichtet.
Am 1. August 1683 wurde die Kirche ihrer Schutzpatronin „St. Anna" geweiht und vom Corveyer Abt Christoph von Bellinghausen konsekriert.
Die Sakristei (südöstlicher Vorbau) entstand 1896.
In den Jahren der Arbeitslosigkeit 1922/23 fanden sich die Bödexer Maurer unter Pfarrer Johannes Todt zusammen und errichteten an der nordwestlichen Seite der Kirche den – das Gebäude prägenden – Turm.
Die Sandsteinquader wurden am Mönkeberg (unter dem Köterberg) gebrochen.
Die Kirchenfenster stammen aus dem Jahr 1941.
Die Kreuzigungsgruppe auf der Stirnwand wurde nach dem 2. Weltkrieg von dem Künstler Hans Werdehausen geschaffen, dessen Vorfahren aus Bödexen stammten. In den 70-er Jahren entschloss sich die katholische Kirchengemeinde St. Anna zum Bau einer neuen Kirche in der Nähe der zuvor neu errichteten Schule (heute: „Haus des Gastes").
Um dieses historische Kirchengebäude, das an markanter Stelle das Dorfbild bestimmt, vor dem Abbruch zu bewahren, schlossen sich im Jahre 1979 Freunde und Förderer zum Förderverein Historisches Kirchengebäude Bödexen e.V. zusammen.
Sie erwarben das Eigentum an dem Kirchgrund, der früher als Friedhof genutzt worden war, und am Kirchengebäude.
Durch Vereinsbeiträge, Spenden, freiwilligen Arbeitseinsatz und Erträge des Ostereiermarktes (Palmsonntag) Samstag und Sonntag 10.00 bis 18.00 Uhr wird dieses Kirchengebäude erhalten und unterhalten.